87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2864 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  93.29 
 
 		 164 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  93.29 
 
 		 164 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  93.29 
 
 		 164 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  92.68 
 
 		 164 aa  309  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  89.63 
 
 		 164 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  89.63 
 
 		 164 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  89.02 
 
 		 164 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  88.41 
 
 		 164 aa  298  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  71.95 
 
 		 164 aa  239  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  71.34 
 
 		 164 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  69.51 
 
 		 164 aa  236  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  70.19 
 
 		 169 aa  234  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  67.07 
 
 		 164 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  66.05 
 
 		 165 aa  220  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  65.22 
 
 		 164 aa  218  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  46.63 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  46.84 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  42.95 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  42.14 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.38 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.38 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  42.86 
 
 		 213 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  41.51 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  42.47 
 
 		 207 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  42.47 
 
 		 207 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  42.47 
 
 		 207 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  42.07 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  40.14 
 
 		 182 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.73 
 
 		 186 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.57 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.57 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  35.19 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  35.19 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  35.19 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  35.19 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  35.19 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  35.19 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  35.19 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.19 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.19 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.19 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.19 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.19 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  34.46 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  33.95 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  31.1 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  29.33 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  28.67 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  28.67 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  31.51 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  29.65 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  29.07 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  26.95 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  26.9 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  31.13 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  27.95 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  28.24 
 
 		 177 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  26.71 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  25.15 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  30.71 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  25.33 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  26.35 
 
 		 201 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  25.33 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  22.84 
 
 		 172 aa  43.9  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  26 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  29.14 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  26.95 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  28.1 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  27.78 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  25.33 
 
 		 208 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  28.12 
 
 		 173 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  26.67 
 
 		 176 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  26.95 
 
 		 183 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  27.21 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>