21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2602 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  100 
 
 
141 aa  276  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  87.94 
 
 
141 aa  243  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  87.94 
 
 
141 aa  243  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  87.94 
 
 
141 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  87.94 
 
 
141 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  85.11 
 
 
141 aa  236  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  85.11 
 
 
141 aa  234  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  85.11 
 
 
141 aa  234  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  84.4 
 
 
141 aa  233  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  57.55 
 
 
157 aa  154  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  56.03 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  57.45 
 
 
141 aa  150  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  58.16 
 
 
141 aa  146  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  53.9 
 
 
141 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  53.9 
 
 
141 aa  140  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  50.45 
 
 
144 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  29.08 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  28.37 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  28.99 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  31.06 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  27.35 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>