65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1555 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  343  8e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  92.9 
 
 		 169 aa  323  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  92.31 
 
 		 169 aa  323  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  92.31 
 
 		 169 aa  323  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  92.31 
 
 		 169 aa  323  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  92.31 
 
 		 169 aa  323  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  92.31 
 
 		 169 aa  323  7e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  92.31 
 
 		 169 aa  322  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  91.72 
 
 		 169 aa  322  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  74.56 
 
 		 169 aa  276  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  75.9 
 
 		 168 aa  275  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  74.25 
 
 		 168 aa  273  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  76.51 
 
 		 168 aa  268  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  74.85 
 
 		 167 aa  266  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  72.19 
 
 		 169 aa  265  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  73.58 
 
 		 159 aa  254  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  58.58 
 
 		 169 aa  214  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  55.62 
 
 		 174 aa  209  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  57.49 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  56.89 
 
 		 169 aa  207  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  57.4 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  54.49 
 
 		 176 aa  200  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  54.44 
 
 		 180 aa  190  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  49.4 
 
 		 174 aa  190  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  43.71 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  46.2 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  44.97 
 
 		 208 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  43.2 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  44.51 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  43.9 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  43.79 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  47.77 
 
 		 210 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  46.11 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  41.42 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  44.51 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  44.38 
 
 		 188 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  49.33 
 
 		 163 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  46.11 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  44.64 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  41.92 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  36.94 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  38.99 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  43.61 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  33.7 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  36.26 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  33.73 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  35.58 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  34.81 
 
 		 163 aa  90.9  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  33.52 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  43.43 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  28.74 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  37.23 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  30.3 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  31.52 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  28.49 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  25.73 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  29.81 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  30.36 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  29.11 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  28.8 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  29.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  27.74 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  27.5 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  27.73 
 
 		 165 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  28.83 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>