16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0466 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0466  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0083717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0406  hypothetical protein  95.35 
 
 
172 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00038042  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0392  hypothetical protein  94.77 
 
 
172 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144961  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0380  hypothetical protein  94.77 
 
 
172 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0074269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0381  hypothetical protein  94.25 
 
 
179 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000537441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3593  hypothetical protein  75 
 
 
172 aa  275  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.272187  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0363  hypothetical protein  74.42 
 
 
172 aa  274  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3766  hypothetical protein  75 
 
 
172 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4244  hypothetical protein  83.72 
 
 
172 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3833  hypothetical protein  38.92 
 
 
170 aa  131  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3477  hypothetical protein  40.23 
 
 
179 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.310415  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0331  hypothetical protein  34.68 
 
 
177 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000143905  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1949  hypothetical protein  32.52 
 
 
150 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1976  hypothetical protein  32.52 
 
 
150 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0243913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1103  hypothetical protein  31.11 
 
 
197 aa  67.4  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2179  hypothetical protein  31.62 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>