18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2655 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  50.52 
 
 
197 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  50.52 
 
 
197 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  50.52 
 
 
197 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  48.45 
 
 
197 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  47.94 
 
 
197 aa  184  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  46.53 
 
 
219 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3494  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  39.31 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2964  hypothetical protein  37.14 
 
 
190 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  38.64 
 
 
185 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  32.97 
 
 
196 aa  99.4  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  32.95 
 
 
188 aa  89  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  32 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  26.4 
 
 
455 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0328  hypothetical protein  23.68 
 
 
289 aa  58.9  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227086  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70220  hypothetical protein  49.02 
 
 
63 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1128  hypothetical protein  40.68 
 
 
64 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00652499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>