16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3833 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3833  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3593  hypothetical protein  38.55 
 
 
172 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.272187  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3766  hypothetical protein  38.55 
 
 
172 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0363  hypothetical protein  37.95 
 
 
172 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0466  hypothetical protein  38.92 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0083717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0380  hypothetical protein  37.13 
 
 
172 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0074269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0406  hypothetical protein  36.53 
 
 
172 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00038042  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0392  hypothetical protein  35.93 
 
 
172 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144961  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0381  hypothetical protein  36.69 
 
 
179 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000537441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4244  hypothetical protein  37.13 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3477  hypothetical protein  32.14 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.310415  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0331  hypothetical protein  29.09 
 
 
177 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000143905  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1949  hypothetical protein  28.99 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1976  hypothetical protein  28.99 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0243913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1103  hypothetical protein  23.58 
 
 
197 aa  53.9  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2179  hypothetical protein  22.95 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>