17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2189 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2189  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  187  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  65.56 
 
 
90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  62.22 
 
 
90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  58.89 
 
 
90 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  58.89 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  58.89 
 
 
90 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  55.56 
 
 
90 aa  123  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  57.78 
 
 
92 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  52.22 
 
 
91 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  46.07 
 
 
93 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  45.56 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  40.45 
 
 
90 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  38.2 
 
 
93 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3192  hypothetical protein  29.55 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  28.09 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>