17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1089 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1089  type IV pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 145 aa  288  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1297  type IV pilus assembly protein PilX  60.84 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1127  type IV pilus assembly protein PilX  52.9 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1162  type IV pilus assembly protein PilX  52.9 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1060  type IV pilus assembly protein PilX  52.9 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3229  hypothetical protein  52.26 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1065  type IV pilus assembly protein PilX  52.7 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3526  hypothetical protein  52.9 
 
 		 153 aa  156  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2951  type IV pilus assembly protein PilX  52.67 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.114107  normal  0.117946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1200  type IV pilus assembly protein PilX  50.68 
 
 		 144 aa  154  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3033  type IV pilus assembly protein PilX  52.53 
 
 		 156 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3130  type IV pilus assembly protein PilX  51.61 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.706597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0930  type IV pilus assembly protein PilX  50.94 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.881011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1105  type IV pilus assembly protein PilX  52.74 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.711381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2884  type IV pilus assembly protein PilX  45.77 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2717  type IV pilus assembly protein PilX  55 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1215  hypothetical protein  31.1 
 
 		 182 aa  70.1  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>