16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1057 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1057  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  226  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2914  hypothetical protein  49.5 
 
 
114 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  45.28 
 
 
111 aa  103  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2748  hypothetical protein  49.48 
 
 
111 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344464  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1218  hypothetical protein  51.49 
 
 
111 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1262  hypothetical protein  51.49 
 
 
111 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1295  hypothetical protein  51.49 
 
 
111 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3095  hypothetical protein  51.49 
 
 
111 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.038994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1365  hypothetical protein  44.55 
 
 
111 aa  90.5  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2830  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3009  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2912  hypothetical protein  44.55 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1176  hypothetical protein  44.55 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1167  hypothetical protein  45.28 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0897  hypothetical protein  41 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.787189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1071  hypothetical protein  43.75 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>