16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0997 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0997  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  328  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1111  hypothetical protein  71.7 
 
 
159 aa  248  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1213  hypothetical protein  71.97 
 
 
158 aa  248  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1023  hypothetical protein  69.03 
 
 
159 aa  235  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2878  hypothetical protein  66.24 
 
 
163 aa  227  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00543287  hitchhiker  0.000193701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0851  hypothetical protein  67.76 
 
 
157 aa  227  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.403973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2960  hypothetical protein  65.61 
 
 
163 aa  225  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.373099  hitchhiker  0.00896796 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3056  hypothetical protein  66.88 
 
 
163 aa  225  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469706  normal  0.0518674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1318  hypothetical protein  66.24 
 
 
163 aa  224  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1172  hypothetical protein  64.42 
 
 
163 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0188843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1249  hypothetical protein  64.42 
 
 
163 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3141  hypothetical protein  64.42 
 
 
163 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335339  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1216  hypothetical protein  64.6 
 
 
163 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1130  hypothetical protein  66.45 
 
 
153 aa  221  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.165556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2970  hypothetical protein  62.89 
 
 
158 aa  215  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2805  hypothetical protein  63.06 
 
 
157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>