24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0276 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0306  hypothetical protein  65.61 
 
 
503 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3984  hypothetical protein  61.38 
 
 
548 aa  698    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0379  hypothetical protein  63.27 
 
 
543 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4180  hypothetical protein  61.02 
 
 
548 aa  696    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0276  hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1160    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4221  hypothetical protein  65.62 
 
 
517 aa  722    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.256943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4062  hypothetical protein  61.38 
 
 
548 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3685  hypothetical protein  59.2 
 
 
549 aa  680    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0230  hypothetical protein  63.26 
 
 
569 aa  739    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.769697  normal  0.583487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4093  hypothetical protein  60.84 
 
 
548 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245434  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3352  hypothetical protein  56.26 
 
 
546 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3877  hypothetical protein  61.14 
 
 
546 aa  694    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413132  normal  0.0515255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0393  hypothetical protein  57.87 
 
 
559 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0272  hypothetical protein  60.99 
 
 
546 aa  692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3673  hypothetical protein  63.67 
 
 
546 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3442  hypothetical protein  59.96 
 
 
550 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.325746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0927  hypothetical protein  33.39 
 
 
608 aa  309  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.943956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0256  hypothetical protein  30.37 
 
 
560 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.17253  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0286  hypothetical protein  27.44 
 
 
546 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399443  hitchhiker  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2958  hypothetical protein  27.54 
 
 
609 aa  64.3  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725385  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1656  hypothetical protein  29.86 
 
 
627 aa  62.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.558221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2475  hypothetical protein  28.87 
 
 
611 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.641856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0364  hypothetical protein  26.98 
 
 
683 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614436  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0339  hypothetical protein  26.67 
 
 
639 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.809143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>