15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5661 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5661  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  275  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14040  hypothetical protein  32.17 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.593323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23530  hypothetical protein  27.97 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0377925  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5504  hypothetical protein  26.4 
 
 
188 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00506408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2153  hypothetical protein  29.2 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2684  hypothetical protein  30.36 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32830  hypothetical protein  28.04 
 
 
150 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4221  hypothetical protein  34.23 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0934  hypothetical protein  34.38 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3084  hypothetical protein  26.45 
 
 
217 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03920  hypothetical protein  25.23 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0535  hypothetical protein  26.92 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000537428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5164  hypothetical protein  29.41 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5552  hypothetical protein  30.56 
 
 
120 aa  42  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4298  hypothetical protein  27.13 
 
 
248 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>