20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5418 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 409 aa  810    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  68.22 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  33.16 
 
 		 405 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  33.02 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  32.61 
 
 		 367 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  35.71 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  39.51 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  38.22 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  36.02 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  35.03 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  31.99 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  36.79 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  34.62 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  31.51 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  32.02 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  25.56 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  30.91 
 
 		 242 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  27.65 
 
 		 466 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  32.86 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  25.97 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>