28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4034 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4034  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  138  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2949  normal  0.231801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6793  hypothetical protein  73.91 
 
 
70 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7210  hypothetical protein  64.71 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8454  hypothetical protein  67.65 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071373  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1623  hypothetical protein  66.18 
 
 
77 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3038  hypothetical protein  65.22 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0700  hypothetical protein  64.41 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0714  hypothetical protein  64.41 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0416278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0694  hypothetical protein  64.41 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548388  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3156  hypothetical protein  59.09 
 
 
68 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1761  hypothetical protein  60.94 
 
 
74 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000459552  normal  0.237306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3019  hypothetical protein  63.16 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  hitchhiker  0.0088907 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0726  hypothetical protein  57.58 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7220  hypothetical protein  62.96 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21130  hypothetical protein  62.71 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3539  hypothetical protein  56.25 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0766  hypothetical protein  62.07 
 
 
81 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25220  hypothetical protein  54.69 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104081  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1048  hypothetical protein  54.84 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0166  hypothetical protein  57.63 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4685  hypothetical protein  58.49 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.0563131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2786  hypothetical protein  66.15 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.174282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1784  hypothetical protein  54.41 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00678784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3380  hypothetical protein  62.22 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0872841  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3763  hypothetical protein  52.94 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1599  hypothetical protein  52.94 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.124638  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  48.28 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20520  hypothetical protein  43.4 
 
 
199 aa  43.5  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>