20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3603 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 
409 aa  803    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  68.22 
 
 
409 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  31.76 
 
 
405 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  29.86 
 
 
381 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  34.77 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  32.52 
 
 
399 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  33.93 
 
 
358 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  35.45 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  32.69 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  34.91 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  31.53 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  33.69 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  32.65 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  32.85 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  32.74 
 
 
242 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  25.69 
 
 
404 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  32.37 
 
 
491 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  26.77 
 
 
466 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  28.38 
 
 
409 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  27.81 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>