21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2938 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2938  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  340  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00841158  hitchhiker  0.000372001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6815  hypothetical protein  55.63 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3883  hypothetical protein  43.71 
 
 
157 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01390  hypothetical protein  35.76 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4040  hypothetical protein  38.96 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1878  hypothetical protein  34.43 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000380113  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1903  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3497  hypothetical protein  31.5 
 
 
160 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1374  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.719868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3143  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1257  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2725  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
157 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12640  hypothetical protein  32.5 
 
 
175 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.80444  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06045  hypothetical protein  29.91 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2308  TPR domain protein  27.19 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0457067  hitchhiker  0.00000000000588055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2927  TPR domain protein  23.58 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4835500000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2928  TPR domain-containing protein  23.58 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2967  TPR domain-containing protein  23.58 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2974  TPR domain protein  23.58 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2649  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2720  TPR domain-containing protein  23.58 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>