11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2159 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2159  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.405692  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6047  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1766  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5313  hypothetical protein  28.47 
 
 
130 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2139  hypothetical protein  23.45 
 
 
145 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199816  normal  0.432995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4194  hypothetical protein  24.16 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202157  decreased coverage  0.00550035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0597  hypothetical protein  27.36 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.759562  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5772  hypothetical protein  27.01 
 
 
157 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4789  hypothetical protein  34.62 
 
 
548 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6004  hypothetical protein  26.95 
 
 
162 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000578115  normal  0.0758931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0107  hypothetical protein  25.49 
 
 
126 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.952961  normal  0.607033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>