10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0053 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_R0053  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0013  5S ribosomal RNA  94.34 
 
 		 108 bp  163  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0019  5S ribosomal RNA  94.34 
 
 		 108 bp  163  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0035  5S ribosomal RNA  94.34 
 
 		 108 bp  163  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0049  5S ribosomal RNA  94.34 
 
 		 108 bp  163  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0055  5S ribosomal RNA  94.34 
 
 		 108 bp  163  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0005  5S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 114 bp  54  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.247177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0022  5S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 114 bp  54  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000398716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0027  5S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 114 bp  54  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.733223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0054  5S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 114 bp  54  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.238713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>