10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5692 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5692  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1016    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1364  hypothetical protein  28.43 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1335  hypothetical protein  28.43 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 1182 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1885  hypothetical protein  32.76 
 
 		 676 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3894  hypothetical protein  29.87 
 
 		 982 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1202  hypothetical protein  29.79 
 
 		 643 aa  57  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.898253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1067  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.65 
 
 		 1224 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.395235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4562  hypothetical protein  31.88 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4037  hypothetical protein  33.64 
 
 		 575 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>