31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5023 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  31.78 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  32.61 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  29.55 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  29.97 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  30.25 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  28.35 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  33.33 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  30.29 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  29.25 
 
 		 374 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  29.25 
 
 		 369 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  28.79 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  32.3 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  26.75 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  29.78 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  24.71 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  31.16 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  24.24 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  30.33 
 
 		 779 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.22 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  27.45 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  24.48 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  23.26 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  26.43 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  24.09 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  24.09 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  26.03 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  23.66 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  23.38 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  16.37 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>