20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4055 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4055  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  61.42 
 
 		 272 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  63.56 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  65.98 
 
 		 270 aa  318  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  44.16 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  39.31 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  38.87 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  38.93 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  38.93 
 
 		 304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  40.28 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  37.33 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  27.91 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  28.99 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  27.93 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4164  hypothetical protein  28.95 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  26.62 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  28.99 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  24.69 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  28.97 
 
 		 194 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>