24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1933 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1933  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2731  NUDIX hydrolase  47.68 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0380829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2477  NUDIX hydrolase  45.42 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2774  hypothetical protein  47.23 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1332  nudix hydrolase  31.44 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1818  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2256  hypothetical protein  30.17 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.690803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0671  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.338441  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3332  hypothetical protein  30.53 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6065  hypothetical protein  32.68 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2109  hypothetical protein  32.63 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2672  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2899  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3239  hypothetical protein  34.18 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2717  hypothetical protein  32.62 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1149  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1375  hypothetical protein  26.64 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0980  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0220325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2794  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1328  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0955  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1441  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.364896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3658  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0131  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>