15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1535 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1535  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2245  hypothetical protein  48.8 
 
 		 224 aa  207  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  53.44 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  52.11 
 
 		 208 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1411  hypothetical protein  42.42 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  42.72 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  43.72 
 
 		 197 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  44.44 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  22.82 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4366  hypothetical protein  26.04 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2949  secreted Zn-dependent protease-like protein  21.95 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  22.47 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3701  hypothetical protein  25.62 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4432  hypothetical protein  22.28 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2684  protein of unknown function DUF922  22.02 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0966382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>