32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1043 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1043  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2200  hypothetical protein  66.01 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1855  type IV pilus assembly PilZ  63.05 
 
 		 203 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0262273  normal  0.0162783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2055  type IV pilus assembly PilZ  61.58 
 
 		 203 aa  268  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1935  type IV pilus assembly PilZ  50.51 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3133  type IV pilus assembly PilZ  47.94 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1725  type IV pilus assembly PilZ  48.85 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3901  type IV pilus assembly PilZ  50.28 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5217  hypothetical protein  47.12 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2571  hypothetical protein  44.33 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520681  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3278  type IV pilus assembly PilZ  46.96 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2147  type IV pilus assembly PilZ  46.96 
 
 		 203 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2168  hypothetical protein  44.85 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136953  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4632  type IV pilus assembly PilZ  45.36 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5127  type IV pilus assembly PilZ  47.93 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3234  type IV pilus assembly PilZ  44.39 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2533  type IV pilus assembly PilZ  41.4 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2258  type IV pilus assembly PilZ  41.4 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2215  type IV pilus assembly PilZ  42.05 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2643  type IV pilus assembly PilZ  35.94 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.615004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1695  type IV pilus assembly PilZ  32.61 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0558499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969553  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1075  type IV pilus assembly PilZ  33.89 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1802  type IV pilus assembly PilZ  31.77 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5681  hypothetical protein  33.55 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0235  type IV pilus assembly PilZ  31.76 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4427  type IV pilus assembly PilZ  29.94 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5084  type IV pilus assembly PilZ  29.61 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0293715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3224  type IV pilus assembly PilZ  26.32 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3033  type IV pilus assembly PilZ  25.66 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3257  type IV pilus assembly PilZ  25.66 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4163  type IV pilus assembly PilZ  27.88 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>