50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0679 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  44.25 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  42.35 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  42.62 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  41.95 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  34.74 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  41.77 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  41.77 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  44.44 
 
 		 177 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  36.02 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  34.55 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  44.04 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  44.04 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  39.81 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  31.41 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  29.63 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  29.94 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  29.94 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  29.52 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  30.43 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  29.49 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  33.57 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  34.42 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  28.66 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  29.49 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  31.16 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  31.16 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  42.67 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  34.06 
 
 		 162 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  34.72 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  28.99 
 
 		 160 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  27.5 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  29.93 
 
 		 165 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  29.53 
 
 		 159 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  25.13 
 
 		 397 aa  48.9  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  37.84 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 377 aa  45.4  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  27.34 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  33.78 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  38.83 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  25.95 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  26.81 
 
 		 172 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  26.21 
 
 		 175 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  25.95 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>