13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0521 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0521  hypothetical protein  100 
 
 		 46 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1043  hypothetical protein  76.19 
 
 		 45 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  70.45 
 
 		 46 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0645  hypothetical protein  65.12 
 
 		 46 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  46.67 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  52.38 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  54.55 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  54.55 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0902  CoxF protein  58.82 
 
 		 55 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0674992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  53.85 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  47.73 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  47.73 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4503  hypothetical protein  54.29 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.740711  normal  0.327567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>