18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0137 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171445  normal  0.390949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0187  hypothetical protein  66.18 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0216  hypothetical protein  66.18 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378879  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0579  hypothetical protein  61.03 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0429  hypothetical protein  56.49 
 
 		 136 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0510307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0740  hypothetical protein  54.55 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0789  hypothetical protein  53.79 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3970  hypothetical protein  54.14 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0016  hypothetical protein  46.28 
 
 		 145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3038  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3618  hypothetical protein  40.77 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.852641  normal  0.135457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2260  hypothetical protein  41.09 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0583  hypothetical protein  41.98 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2236  hypothetical protein  41.98 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2205  hypothetical protein  41.09 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0486  hypothetical protein  40.77 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.609033  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1577  hypothetical protein  35.59 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401749  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1320  hypothetical protein  35.59 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0990906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>