12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2534 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2534  Variant SH3 domain protein  100 
 
 		 118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0383  SH3 domain-containing protein  51.33 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3571  SH3 domain-containing protein  50.88 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541484  normal  0.671708 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3074  hypothetical protein  42.61 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3400  SH3 domain-containing protein  42.61 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3378  SH3 domain protein  41.74 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3404  SH3 domain protein  40.35 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0826  SH3 domain-containing protein  32.46 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.640875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3548  SH3 domain-containing protein  31.03 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3748  Variant SH3 domain protein  31.9 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04226  variant SH3 domain protein  28.3 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0111  Variant SH3 domain protein  26.32 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>