48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2156 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2156  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  367  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3430  hypothetical protein  45.89 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0305  hypothetical protein  33.73 
 
 
193 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6211  hypothetical protein  42.86 
 
 
182 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71580  hypothetical protein  42.14 
 
 
182 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5045  hypothetical protein  40.88 
 
 
180 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.110017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0141  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2133  hypothetical protein  37.27 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0115  hypothetical protein  42.41 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5491  hypothetical protein  39.49 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2155  hypothetical protein  51.96 
 
 
206 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5619  hypothetical protein  38.46 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0505  putative lipoprotein  36.77 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0127462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0540  hypothetical protein  36.77 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11280  hypothetical protein  37.34 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1036  hypothetical protein  37.34 
 
 
172 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06620  hypothetical protein  39.07 
 
 
171 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00771  hypothetical protein  33.77 
 
 
164 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0558  lipoprotein  36.13 
 
 
171 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  0.717571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0550  lipoprotein  35.48 
 
 
190 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.916886 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0425  hypothetical protein  36.96 
 
 
161 aa  104  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01230  hypothetical protein  40.13 
 
 
195 aa  104  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4472  putative lipoprotein  36.77 
 
 
174 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0680  lipoprotein, putative  36.77 
 
 
174 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001702  hypothetical protein  34.42 
 
 
164 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5241  hypothetical protein  38.73 
 
 
177 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  0.106495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5333  hypothetical protein  38.73 
 
 
189 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0142  hypothetical protein  37.67 
 
 
153 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5028  putative lipoprotein  34.19 
 
 
172 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5382  hypothetical protein  38.97 
 
 
177 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1814  hypothetical protein  31.71 
 
 
189 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3866  hypothetical protein  41.96 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1973  hypothetical protein  38.89 
 
 
232 aa  87.8  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3492  hypothetical protein  31.61 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3556  hypothetical protein  46.67 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00217  lipoprotein, putative  35.97 
 
 
158 aa  85.5  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1843  hypothetical protein  46.07 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1829  hypothetical protein  42.42 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1562  hypothetical protein  42.7 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0303  hypothetical protein  29.81 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.965134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2285  hypothetical protein  46.99 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4181  hypothetical protein  37.36 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3393  hypothetical protein  33.57 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191739  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0703  hypothetical protein  34.58 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00895458  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3621  hypothetical protein  36.26 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05705  hypothetical protein  34.95 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3013  hypothetical protein  40.85 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195597  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4728  hypothetical protein  45.71 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>