29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0357 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  100 
 
 
321 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  57.56 
 
 
335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  51.58 
 
 
319 aa  298  6e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  51.58 
 
 
319 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  35.42 
 
 
328 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  35.26 
 
 
456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  34.07 
 
 
335 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  33.44 
 
 
334 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  33.44 
 
 
318 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  32.82 
 
 
374 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  32.82 
 
 
369 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  31.4 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  33.13 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  36.8 
 
 
323 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  35.38 
 
 
349 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  34.75 
 
 
339 aa  106  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  36.51 
 
 
324 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  36.96 
 
 
342 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.57 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  24.71 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.91 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  33.48 
 
 
779 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  30.38 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  29.72 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.77 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  24.47 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  27.91 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  34.68 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  28.44 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>