17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0088 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235222  normal  0.0227484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1325  hypothetical protein  71.64 
 
 		 205 aa  326  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125239  normal  0.126591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3492  twin-arginine translocation pathway signal  64.96 
 
 		 236 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2095  hypothetical protein  72.53 
 
 		 184 aa  295  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  26.58 
 
 		 827 aa  85.1  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4064  hypothetical protein  29.05 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0129  hypothetical protein  29.74 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0450  hypothetical protein  29.52 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  29.02 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1353  hypothetical protein  26.27 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.187425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1596  hypothetical protein  26.22 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4595  hypothetical protein  25.76 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.6728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  27.86 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  27.86 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  27.86 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13153  hypothetical protein  26.5 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0280148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  27.8 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>