43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5924 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 500 aa  1033    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  64.08 
 
 		 496 aa  667    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  59.92 
 
 		 510 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  58.87 
 
 		 494 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  71.92 
 
 		 500 aa  754    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  60.93 
 
 		 497 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  59.8 
 
 		 502 aa  630  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  54.97 
 
 		 497 aa  614  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  56.19 
 
 		 495 aa  604  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  39.22 
 
 		 507 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  39.02 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  36.73 
 
 		 502 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  36.92 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  37.72 
 
 		 510 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  35.85 
 
 		 502 aa  322  9.000000000000001e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  35.73 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  37.93 
 
 		 509 aa  315  9e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  35.23 
 
 		 504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  37.47 
 
 		 514 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  37.47 
 
 		 514 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  34.27 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  33.62 
 
 		 522 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  32.93 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  32.16 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  32.5 
 
 		 521 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  33.05 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  35.24 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  29.61 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  31.16 
 
 		 528 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  31.95 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  30 
 
 		 527 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  31.2 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  30.72 
 
 		 539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  28.15 
 
 		 528 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  25.5 
 
 		 559 aa  137  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  24.54 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  23.69 
 
 		 557 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  43.16 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  22.15 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  23.02 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  22.05 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  30.12 
 
 		 581 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  30.95 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>