45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5651 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  63.67 
 
 		 504 aa  715    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 507 aa  1060    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  56.09 
 
 		 502 aa  626  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  56.46 
 
 		 504 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  51.57 
 
 		 508 aa  592  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  53.17 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  50.4 
 
 		 502 aa  555  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  49.6 
 
 		 507 aa  551  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  49.38 
 
 		 484 aa  530  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  42.8 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  40 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  38.77 
 
 		 494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  39.22 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  38.46 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  37.29 
 
 		 510 aa  333  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  36.29 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  38.3 
 
 		 502 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  37.85 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  35.5 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  34.95 
 
 		 514 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  34.95 
 
 		 514 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  33.74 
 
 		 522 aa  280  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  32.78 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  33.74 
 
 		 514 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  36.47 
 
 		 512 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  31.89 
 
 		 510 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  31.15 
 
 		 527 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  30.49 
 
 		 562 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  32.37 
 
 		 530 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  29.48 
 
 		 508 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  29.53 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  30.45 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  28.96 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  27.84 
 
 		 507 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  23.8 
 
 		 586 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  23.93 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  22.74 
 
 		 581 aa  80.5  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  31.37 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  22.44 
 
 		 532 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  38.2 
 
 		 128 aa  67  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  21.35 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  23.44 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1190  GH3 auxin-responsive promoter  20.5 
 
 		 543 aa  53.5  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.259231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  26.63 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  30 
 
 		 547 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>