23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2733 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2733  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1153    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  hitchhiker  0.00174807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1617  hypothetical protein  56.47 
 
 		 579 aa  615  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0549  hypothetical protein  52.54 
 
 		 542 aa  547  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0550  hypothetical protein  49.62 
 
 		 523 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0336  hypothetical protein  48.98 
 
 		 492 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0136782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0552  hypothetical protein  45.3 
 
 		 504 aa  435  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.677753  normal  0.24778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0551  hypothetical protein  43.26 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0557  hypothetical protein  38.98 
 
 		 487 aa  292  9e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0555  hypothetical protein  39.07 
 
 		 442 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.589483  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2081  hypothetical protein  39.39 
 
 		 444 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.252224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0556  hypothetical protein  37.39 
 
 		 515 aa  263  8.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.253273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2732  hypothetical protein  37.38 
 
 		 449 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  hitchhiker  0.00119476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2082  hypothetical protein  38.14 
 
 		 476 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  0.181535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2083  hypothetical protein  32.96 
 
 		 493 aa  250  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  0.196729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1618  hypothetical protein  35.4 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.483238  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0558  hypothetical protein  31.64 
 
 		 467 aa  248  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.675961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0337  hypothetical protein  36.27 
 
 		 448 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0548  hypothetical protein  37.69 
 
 		 390 aa  226  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5342  hypothetical protein  32.7 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0256  DoxX family protein  29.7 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4334  hypothetical protein  25.98 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0868  hypothetical protein  22.99 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06020  hypothetical protein  25.32 
 
 		 353 aa  54.3  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.305074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>