17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1353 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1353  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.187425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0450  hypothetical protein  73.24 
 
 
220 aa  345  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1596  hypothetical protein  64.95 
 
 
220 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4064  hypothetical protein  68.88 
 
 
218 aa  291  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4595  hypothetical protein  56.22 
 
 
212 aa  271  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.6728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0129  hypothetical protein  52.05 
 
 
225 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13153  hypothetical protein  54.42 
 
 
214 aa  248  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0280148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3492  twin-arginine translocation pathway signal  29.22 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1325  hypothetical protein  27.54 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125239  normal  0.126591 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0088  hypothetical protein  26.54 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235222  normal  0.0227484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2095  hypothetical protein  29.24 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  26.92 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  28.86 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  26.54 
 
 
827 aa  65.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  28.36 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  29.35 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  25.7 
 
 
280 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>