17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1325 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1325  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125239  normal  0.126591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2095  hypothetical protein  88.59 
 
 
184 aa  352  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0088  hypothetical protein  71.64 
 
 
235 aa  324  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235222  normal  0.0227484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3492  twin-arginine translocation pathway signal  69.8 
 
 
236 aa  321  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4064  hypothetical protein  31.4 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0129  hypothetical protein  30.81 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  25.24 
 
 
255 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1596  hypothetical protein  29.05 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  27.96 
 
 
827 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1353  hypothetical protein  27.54 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.187425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0450  hypothetical protein  27.41 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4595  hypothetical protein  29.38 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.6728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  25.87 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13153  hypothetical protein  29 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0280148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  26.37 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  26.37 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  24.64 
 
 
280 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>