37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0118 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 508 aa  1054    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  57.14 
 
 		 507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  44.82 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  45.11 
 
 		 521 aa  472  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  42.18 
 
 		 510 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  44.11 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  32.64 
 
 		 484 aa  269  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  32.99 
 
 		 507 aa  256  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  33.47 
 
 		 509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  31.26 
 
 		 502 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  31.67 
 
 		 510 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  33.05 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  31.82 
 
 		 502 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  29.75 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  32.52 
 
 		 514 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  32.52 
 
 		 514 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  31.03 
 
 		 504 aa  239  6.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  30.44 
 
 		 502 aa  239  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  32.01 
 
 		 497 aa  238  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  31.57 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  31.42 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  29.84 
 
 		 508 aa  237  3e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  31 
 
 		 495 aa  236  8e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  32.1 
 
 		 522 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  30.91 
 
 		 562 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  30.54 
 
 		 496 aa  231  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  30.43 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  29.48 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  29.88 
 
 		 530 aa  219  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  30.59 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  30.41 
 
 		 497 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  29.36 
 
 		 539 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  29.13 
 
 		 528 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  24.07 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  23.18 
 
 		 559 aa  97.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  24.26 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  34.38 
 
 		 128 aa  43.5  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>