20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37910 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  100 
 
 		 751 aa  1420    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  34.17 
 
 		 820 aa  284  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  32 
 
 		 728 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  34.58 
 
 		 711 aa  228  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  33.38 
 
 		 703 aa  197  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  29.06 
 
 		 741 aa  167  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  27.39 
 
 		 884 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  28.02 
 
 		 820 aa  124  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  31.42 
 
 		 717 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  25.72 
 
 		 706 aa  111  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  28.18 
 
 		 835 aa  111  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  26.74 
 
 		 814 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  25.68 
 
 		 713 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  28.43 
 
 		 919 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  27.64 
 
 		 784 aa  71.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1447  hypothetical protein  22.75 
 
 		 733 aa  61.2  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  25.14 
 
 		 870 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4682  hypothetical protein  26.41 
 
 		 735 aa  50.8  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  25 
 
 		 706 aa  50.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  25.52 
 
 		 718 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>