25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31350  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  250  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2043  protein of unknown function DUF180  44.8 
 
 		 123 aa  90.5  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  39.68 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  38.1 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  38.52 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  32.76 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  37.74 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  29.51 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  30.58 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3002  protein of unknown function DUF180  33.33 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374765 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  28.23 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  28.18 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  28.93 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  29.75 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  27.05 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  26.23 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  32.5 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  25 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  25.58 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  27.73 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  29.36 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  29.27 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0858  protein of unknown function DUF180  26.96 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  26.89 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>