66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  54.67 
 
 		 160 aa  173  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  56.12 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  32.09 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  34.46 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  34.51 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  30.6 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  29.08 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  32.84 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  34.67 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  31.39 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  29.58 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  34.51 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  33.57 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  26.57 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  31.45 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  31.15 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  28.69 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  33.06 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  31.68 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  28.19 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  27.05 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  30.53 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  30.53 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  28.77 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  21.01 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  23.97 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  34.78 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  27.97 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  23.31 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  26.53 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  21.58 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  21.88 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  27.34 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  28.06 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  23.62 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.41 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  28.06 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  26.09 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  31.07 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  27.61 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  25.55 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  26.87 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  26.28 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  26.09 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  27.01 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  24.31 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  26.15 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  22.96 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  26.43 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  22.22 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  25.81 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  27.27 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  26.09 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  23.91 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  25.19 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  32.2 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  21.31 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>