39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  100 
 
 		 159 aa  322  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  56.05 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  43.59 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  39.01 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  31.76 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  32.21 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  32.89 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  32.45 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  30.87 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  31.72 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  30.07 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  29.41 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  27.7 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  38.46 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  35.9 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  24.84 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  28.97 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  26.97 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  28.17 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1730  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000514392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  30.41 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  28.29 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  29.14 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  28.28 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  28.77 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  29.86 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  29.86 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  22.54 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  21.68 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  25.18 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  24.84 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  26.92 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1729  hypothetical protein  25.64 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000276376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  27.03 
 
 		 147 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  28.67 
 
 		 143 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  28.86 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  25.34 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  24.68 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  23.03 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>