28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25220  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0766  hypothetical protein  69.14 
 
 		 81 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21130  hypothetical protein  69.14 
 
 		 81 aa  119  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0166  hypothetical protein  56.79 
 
 		 81 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2786  hypothetical protein  64.29 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.174282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3019  hypothetical protein  61.67 
 
 		 73 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  hitchhiker  0.0088907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3038  hypothetical protein  61.29 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4034  hypothetical protein  54.69 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2949  normal  0.231801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3156  hypothetical protein  58.73 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7220  hypothetical protein  53.33 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7210  hypothetical protein  52.46 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4685  hypothetical protein  52.94 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.0563131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1761  hypothetical protein  51.43 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000459552  normal  0.237306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0694  hypothetical protein  50.77 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0714  hypothetical protein  50.77 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0726  hypothetical protein  48.53 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0700  hypothetical protein  50.77 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8454  hypothetical protein  53.85 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1623  hypothetical protein  54.84 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6793  hypothetical protein  54.1 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1048  hypothetical protein  48.53 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3380  hypothetical protein  45.1 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0872841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1599  hypothetical protein  44.83 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.124638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3763  hypothetical protein  41.38 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3539  hypothetical protein  43.64 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  40.68 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1784  hypothetical protein  56.41 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00678784  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3453  hypothetical protein  40.98 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0500365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>