173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_24000  predicted glutathione S-transferase  100 
 
 
354 aa  723    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1886  Glutathione transferase  73.31 
 
 
348 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.834128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0467  glutathione S-transferase-like protein  74.86 
 
 
353 aa  531  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4474  putative glutathione S-transferase  75.23 
 
 
334 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4561  putative glutathione S-transferase  75.23 
 
 
334 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0356918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4857  putative glutathione S-transferase  75.23 
 
 
334 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.52119  normal  0.0672443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2149  putative glutathione S-transferase  72.7 
 
 
360 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0779724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3989  putative glutathione S-transferase  72.7 
 
 
350 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1709  putative glutathione S-transferase  76.62 
 
 
338 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0399  glutathione S-transferase-like protein  74.13 
 
 
353 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0073  transferase, putative  74.33 
 
 
344 aa  521  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2241  Glutathione transferase  72.57 
 
 
353 aa  521  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.297423  hitchhiker  0.00102942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0934  glutathione S-transferase  77.47 
 
 
346 aa  521  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1896  putative glutathione S-transferase  72.97 
 
 
361 aa  514  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000046758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5043  putative glutathione S-transferase  75.23 
 
 
343 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2460  Glutathione transferase  73.83 
 
 
337 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0366  glutathione S-transferase-like  76.01 
 
 
342 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0125  Glutathione transferase  73.93 
 
 
341 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19270  predicted glutathione S-transferase  66.02 
 
 
383 aa  482  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3800  putative glutathione S-transferase  74.52 
 
 
345 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30100  predicted glutathione S-transferase  71.85 
 
 
333 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0183728  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2995  hypothetical protein  68.87 
 
 
332 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14600  predicted glutathione S-transferase  63.32 
 
 
358 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0726659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4307  Glutathione transferase  68.56 
 
 
313 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4512  putative glutathione S-transferase  65.53 
 
 
324 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1231  Glutathione transferase  59.88 
 
 
339 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00393287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1669  glutathione transferase  50.99 
 
 
333 aa  295  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8279  Glutathione transferase  50.17 
 
 
297 aa  291  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5405  Glutathione transferase  48.43 
 
 
314 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1068  glutathione S-transferase-like protein  48.37 
 
 
322 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.911478  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0702  putative glutathione S-transferase  45.66 
 
 
327 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2206  glutathione S-transferase domain  48.06 
 
 
330 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2361  hypothetical protein  42.57 
 
 
319 aa  262  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2249  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.93 
 
 
329 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.386562 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2507  hypothetical protein  42.57 
 
 
319 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0169  putative glutathione S-transferase  43.93 
 
 
329 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0205783  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4107  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.59 
 
 
326 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2524  Glutathione S-transferase domain  48.57 
 
 
329 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0524835  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1723  putative glutathione S-transferase  46.62 
 
 
326 aa  258  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.959435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0157  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.58 
 
 
328 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1604  putative glutathione S-transferase  44.81 
 
 
328 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01866  predicted glutathione S-transferase  43.38 
 
 
320 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1276  glutathione S-transferase-like protein  45.83 
 
 
321 aa  255  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.248613  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0368  putative glutathione S-transferase  45.6 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1137  glutathione S-transferase-like protein  45.66 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1060  glutathione S-transferase-like protein  42.72 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0432833  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1579  IMP dehydrogenase/GMP reductase  46.46 
 
 
320 aa  253  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.39795  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2323  Glutathione transferase  46.3 
 
 
338 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.131425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2008  glutathione S-transferase-like protein  45.03 
 
 
319 aa  251  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2185  putative glutathione S-transferase  44.06 
 
 
329 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.755538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0833  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.45 
 
 
325 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4511  glutathione S-transferase-like  42.04 
 
 
320 aa  249  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3798  Glutathione transferase  42.41 
 
 
326 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1761  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  44.13 
 
 
330 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0457126  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1656  glutathione S-transferase-like protein  44.76 
 
 
328 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0858873  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3749  putative glutathione S-transferase domain protein  42.11 
 
 
326 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0614  hypothetical protein  42.67 
 
 
315 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2583  putative glutathione S-transferase  43.65 
 
 
324 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378441  hitchhiker  0.0000439857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0853  putative glutathione S-transferase  43.55 
 
 
328 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02944  glutathione S-transferase  42.67 
 
 
314 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002964  predicted glutathione S-transferase  42.38 
 
 
315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1201  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  44.34 
 
 
323 aa  245  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2451  glutathione S-transferase-like protein  43.47 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1561  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.41 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1509  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.41 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2543  glutathione S-transferase  43.32 
 
 
329 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0355299  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2281  putative glutathione S-transferase  43.83 
 
 
330 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806368  normal  0.334105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30350  hypothetical protein  43.93 
 
 
324 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2382  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.21 
 
 
332 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200845  hitchhiker  0.00582384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4679  glutathione S-transferase  44.05 
 
 
328 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0018476  normal  0.811499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3241  hypothetical protein  44.9 
 
 
322 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2598  hypothetical protein  43.61 
 
 
324 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1455  glutathione S-transferase  43.91 
 
 
326 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2798  putative glutathione S-transferase protein  44.44 
 
 
328 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.830078  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0521  putative glutathione S-transferase  40.43 
 
 
327 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2220  putative glutathione S-transferase  43.48 
 
 
333 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3010  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.2 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0107  glutathione S-transferase  43.55 
 
 
360 aa  239  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.249608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0374  hypothetical protein  45.71 
 
 
309 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.520714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0634  glutathione S-transferase  44.07 
 
 
343 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.240948  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4602  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.41 
 
 
328 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1591  glutathione S-transferase  45.31 
 
 
333 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0102059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3062  Glutathione transferase  45.74 
 
 
336 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.795635  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3402  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.69 
 
 
318 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.291765 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0652  glutathione S-transferase  43.93 
 
 
333 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139367  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1431  Glutathione S-transferase domain  42.77 
 
 
336 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.858691 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0800  glutathione S-transferase family protein  40.52 
 
 
318 aa  236  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.170497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3580  fructose-bisphosphate aldolase  43.82 
 
 
333 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3603  hypothetical protein  44.03 
 
 
319 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.383788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0519  Glutathione transferase  40.97 
 
 
331 aa  235  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0270  glutathione S-transferase-like protein  42.94 
 
 
333 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1170  Glutathione transferase  43.62 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.56227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1116  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.54 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.660957  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0479  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.54 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.342726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3343  glutathione S-transferase domain protein  41.94 
 
 
332 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0543  putative glutathione S-transferase  42.22 
 
 
328 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0242  glutathione S-transferase  43.25 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2639  glutathione S-transferase-like  40.86 
 
 
322 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0953  Glutathione S-transferase domain protein  40.51 
 
 
353 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2137  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.91 
 
 
339 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000359074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>