20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21410  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  474  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787281  normal  0.739491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3964  hypothetical protein  45.58 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1376  hypothetical protein  43.12 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5001  hypothetical protein  39.62 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1082  hypothetical protein  39.02 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00353882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1099  hypothetical protein  39.02 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1110  hypothetical protein  39.02 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5326  hypothetical protein  38.63 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  40.49 
 
 		 455 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1107  hypothetical protein  40.2 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1096  hypothetical protein  40.2 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  0.267536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4772  hypothetical protein  37.9 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.880789  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1080  hypothetical protein  40.2 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4381  hypothetical protein  41.38 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1053  hypothetical protein  42.25 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.876186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1373  hypothetical protein  36.48 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3495  hypothetical protein  37.04 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.969795  normal  0.604812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3915  hypothetical protein  42.47 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366535  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06980  hypothetical protein  34.18 
 
 		 354 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.0886062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2933  hypothetical protein  37.65 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  normal  0.432294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>