16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09080 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09080  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1075    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.391282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2345  hypothetical protein  38.43 
 
 		 507 aa  213  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.274272  hitchhiker  0.00000585461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1859  hypothetical protein  35.32 
 
 		 623 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.163853  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2547  hypothetical protein  39.37 
 
 		 538 aa  195  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1208  hypothetical protein  41.95 
 
 		 528 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1194  hypothetical protein  40.57 
 
 		 577 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1265  hypothetical protein  33.97 
 
 		 558 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20770  hypothetical protein  32.3 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0250367  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0759  hypothetical protein  28.32 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.13019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0753  hypothetical protein  27.17 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0387662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0591  hypothetical protein  21.83 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.373407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2513  hypothetical protein  29.81 
 
 		 471 aa  53.9  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0461  hypothetical protein  29.47 
 
 		 513 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.274744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1384  hypothetical protein  29.3 
 
 		 471 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4066  hypothetical protein  30.86 
 
 		 601 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7607  hypothetical protein  30.92 
 
 		 582 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>