16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04050  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  611  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0246073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3430  hypothetical protein  39.14 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4046  hypothetical protein  37.75 
 
 		 799 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.850338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4439  hypothetical protein  37.09 
 
 		 827 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041911  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1072  hypothetical protein  40.79 
 
 		 704 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1266  hypothetical protein  35.29 
 
 		 990 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2220  hypothetical protein  31.62 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122347  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9101  hypothetical protein  30.77 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2221  hypothetical protein  30.6 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12384  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6576  hypothetical protein  28.79 
 
 		 143 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.102405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1073  hypothetical protein  31.75 
 
 		 120 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1596  hypothetical protein  27.81 
 
 		 771 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0249858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4045  hypothetical protein  33.06 
 
 		 115 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.737073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1595  hypothetical protein  30.95 
 
 		 122 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00120158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1265  hypothetical protein  33.03 
 
 		 122 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4438  hypothetical protein  30.95 
 
 		 121 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245163  hitchhiker  0.000935858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>