17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0742 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0742  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  480  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.10229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1304  hypothetical protein  66.81 
 
 
230 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05048  hypothetical protein  49.33 
 
 
229 aa  254  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0681  hypothetical protein  39.82 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5075  hypothetical protein  39.27 
 
 
230 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  33.18 
 
 
541 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0565  hypothetical protein  37.09 
 
 
230 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.465028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  36.4 
 
 
551 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  33.92 
 
 
567 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  33.92 
 
 
567 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  33.92 
 
 
567 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  33.33 
 
 
543 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  40.33 
 
 
565 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0262  hypothetical protein  38.35 
 
 
233 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1447  hypothetical protein  33.48 
 
 
228 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129718  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2744  hypothetical protein  33.04 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.950913  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0721  hypothetical protein  32.5 
 
 
225 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>