18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0739 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0739  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1301  hypothetical protein  70.33 
 
 
210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05043  hypothetical protein  52.71 
 
 
166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1044  hypothetical protein, putative phage gene  39.62 
 
 
196 aa  131  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0686  hypothetical protein  42.44 
 
 
174 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5070  hypothetical protein  42.44 
 
 
174 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4007  hypothetical protein  40.12 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1452  hypothetical protein  34.02 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.324561  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2784  phage protein  39.33 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2919  phage protein  39.33 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0894575  hitchhiker  0.000000000302279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3475  phage protein  39.33 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2749  hypothetical protein  33.51 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.815887  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0715  putative bacteriophage protein  36.55 
 
 
176 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.851836  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0931  putative bacteriophage protein  33.14 
 
 
207 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678371  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1038  hypothetical protein  36.18 
 
 
219 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0256  hypothetical protein  34.04 
 
 
204 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0571  hypothetical protein  34.39 
 
 
240 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809669  normal  0.240365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0913  phage-like protein  31.4 
 
 
211 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>