20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0602 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0602  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3351  hypothetical protein  97.83 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0748  hypothetical protein  82.22 
 
 
225 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3521  hypothetical protein  91.37 
 
 
197 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3697  hypothetical protein  76.92 
 
 
208 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.176724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3821  hypothetical protein  76.44 
 
 
208 aa  321  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3639  hypothetical protein  76.44 
 
 
208 aa  321  7e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.313555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0808  hypothetical protein  80.9 
 
 
179 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3231  hypothetical protein  74.38 
 
 
201 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0992  hypothetical protein  64.67 
 
 
196 aa  235  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0942  hypothetical protein  64.04 
 
 
194 aa  228  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971072  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0857  hypothetical protein  59.09 
 
 
199 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2897  hypothetical protein  56.93 
 
 
208 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0634  hypothetical protein  59.78 
 
 
205 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0662  hypothetical protein  54.46 
 
 
202 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117194  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1301  hypothetical protein  43.79 
 
 
205 aa  138  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2013  hypothetical protein  40.34 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1568  hypothetical protein  41.26 
 
 
193 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00113128  hitchhiker  0.0000220315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0724  hypothetical protein  35.07 
 
 
223 aa  85.5  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000310173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1740  hypothetical protein  33.01 
 
 
379 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>