24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2923 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2923  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3005  hypothetical protein  95.88 
 
 		 170 aa  339  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3102  hypothetical protein  94.12 
 
 		 170 aa  322  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1262  hypothetical protein  83.03 
 
 		 170 aa  288  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  80.37 
 
 		 169 aa  278  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  82.17 
 
 		 170 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3197  hypothetical protein  80.89 
 
 		 170 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.367183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  80.89 
 
 		 170 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1161  hypothetical protein  80.89 
 
 		 170 aa  253  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0275  hypothetical protein  54.48 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000890841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0542  hypothetical protein  25.9 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3908  hypothetical protein  23.91 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1309  hypothetical protein  23.27 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000696984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4102  hypothetical protein  23.27 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  26.11 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4580  hypothetical protein  21.43 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1577  hypothetical protein  21.8 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3887  hypothetical protein  24.11 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1402  hypothetical protein  22.14 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1785  hypothetical protein  20.97 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0605604  normal  0.726112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47320  hypothetical protein  21.8 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3019  hypothetical protein  31.33 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4083  hypothetical protein  20.3 
 
 		 174 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>